突然「ファイルシステムのエラーです」という警告が表示され、作業が強制的に中断されてしまった経験はありませんか?
- 起動時にエラーメッセージが表示される
- ファイルを開こうとするとアクセスできない
- 外付けHDDやUSBメモリが認識されない
このトラブルの背後には、システムファイルの破損やハードディスクの不具合など、さまざまな原因が潜んでいます。放置すると状況が悪化し、大切なデータが完全に消失するリスクも否定できません。特に誤った操作や繰り返しの再起動は、復旧の可能性を著しく下げてしまいます。
本記事では、ファイルシステムエラーのよくある原因と、安全に行える対処法をわかりやすく解説します。もし「データが消える前に正しい対応を知りたい」と思ったら、まずは無料診断(24時間365日対応)をご利用ください。専門家が迅速に状況を見極め、最適な解決策をご提案します。
目次
「ファイルシステムのエラー」の主な原因
「ファイルシステムのエラー」は、データへのアクセスや保存が正しく行えない際に発生する問題です。このようなエラーが発生する主な原因を以下に詳しく解説します。
システムファイルの破損
「ファイルシステムのエラー」は、システムファイルが破損した際に発生することが多い不具合です。システムファイルはOSがストレージを正しく管理するための重要な情報を担っており、破損するとディスクの読み書きに不具合が生じ、アクセスできないフォルダやエラー表示などが発生します。
原因としては、突然の電源断や強制終了、アップデートの失敗、ウイルス感染、さらにHDD/SSDの経年劣化による不良セクタなどが考えられます。放置するとエラーが拡大し、保存されているデータにも影響が及ぶ可能性があります。
大切なデータが含まれている場合は、専門業者に相談することをおすすめします。
マルウェア感染
悪意のあるプログラム(マルウェア)がファイルシステムを攻撃し、データを破壊または暗号化するケースが挙げられます。特に、不正アクセスを防ぐセキュリティ対策が不十分な場合、ウイルスやランサムウェアによる攻撃でこの問題が発生する可能性が高くなります。
ドライバーの不具合
システムのアップデート後に古いドライバーが互換性を失い、ストレージデバイスとの通信が途絶える場合があります。この結果、ファイルシステムにエラーが発生し、データの読み書きができなくなることがあります。
不良セクター

ファイルを開こうとしたときや、ドライブを操作した際に「ファイルシステムのエラー」と表示される場合、ストレージ内に不良セクターが発生している可能性があります。たとえば、PCの動作が最近重くなってきた、ファイルが急に開けなくなった、保存したデータが消えていたという経験がある方は要注意です。
不良セクターとは、HDDやSSDなどの記憶装置において、データの読み書きができなくなった領域のことです。経年劣化や衝撃、突然の電源切断などが原因で発生し、ファイル構造に影響を与えることで、エラー表示につながります。
この状態で使用を続けると、ほかのデータにも悪影響が広がり、最終的にはドライブ全体の認識ができなくなるリスクがあります。
当社では、不良セクターに起因するファイルシステムのエラーにも対応した無料の初期診断を24時間365日体制で実施しています。異常を感じたら、まずはご相談ください。状況に応じた最適な復旧方法をご提案いたします。
【要注意】自力対応が招くデータ損失のリスク

「ファイルシステムのエラーです」と表示される――そんなトラブルに直面したとき、まずは自力で何とかしようと対応する方が多いと思います。
誤って初期化や上書きをしてしまったり、分解して状態を深刻化させてしまうケースは多く、特に内部の故障が原因だった場合、自力で対応しようとするとかえって悪化を招くリスクがあります。
専門業者であれば、正確な診断に基づいて最適な方法で復旧を進めるため、データ消失を最低限に抑えることができます。中でもデジタルデータリカバリーは、以下の理由から多くの方に選ばれています。
- 相談実績46万件以上(2011年1月~)の豊富な対応経験に基づき、個人・法人問わず幅広いトラブルに対応
- 一部復旧を含む復旧件数割合91.5%(※内、完全復旧57.8%。復旧件数割合=データ復旧件数/データ復旧ご依頼件数。2023年10月実績)という業界トップクラスの技術力
- 他社で「復旧不可」とされた機器の対応実績が7,300件越えにものぼり、独自の復旧技術を保有
大切なデータを守るには、まずは自力対応よりも専門的な判断が欠かせません。操作を誤る前に、まずは当社にご相談ください。
Windowsで「ファイルシステムのエラーです」表示時の対処法

以下に示す対処法を試すことで、多くの「ファイルシステムのエラー」を解決することができます。
システムファイルの修復
システムファイルが破損したり欠損した場合、Windowsが正常に動作しなくなります。「SFC」ツールを使用して、ファイルを自動的に検証・修復します。破損したシステムファイルは、以下の手順で修復できます。
- 「コマンドプロンプト」を管理者権限で開く。
- 「sfc /scannow」を入力し、Enterキーを押す。
- 完了後、PCを再起動してエラーが解決したか確認する。
ハードディスクのチェックと修復
HDD/SSDに不良セクターがある場合、システムが正しくファイルにアクセスできません。「CHKDSK」コマンドでディスクの状態を確認し、不良セクターを修復します。また不良セクタが多くなると、突如認識しなくなることがあります。認識できなくなった際は復旧業者に依頼することを検討しましょう。具体的な手順は次の通りです。
- 「コマンドプロンプト」を管理者権限で開く。
- 「chkdsk C: /f /r」を入力し、Enterキーを押す。
- PCを再起動して、自動修復を行わせる。
ファイルシステムの再構築
ファイルシステムが破損している場合、ドライブへのアクセスができなくなります。DISKPARTコマンドなどを使ってパーティションを再構築し、再フォーマットで復旧を試みます。具体的な手順は次の通りです。
- 「コマンドプロンプト」で「diskpart」と入力する。
- 対象のディスクを選択し、「clean」で初期化する。
- 「create partition primary」で新しいパーティションを作成する。
ドライバーの更新
古いドライバーや互換性のないドライバーが原因で、システムエラーが発生することがあります。デバイスマネージャーからドライバーを最新の状態に更新することで、不具合を解消します。ドライバーの不具合が原因の場合、以下の手順で最新バージョンに更新します。
- 「デバイスマネージャー」を開く。
- 問題のあるデバイスを右クリックし、「ドライバーの更新」を選択する。
- 再起動して、エラーが解消されたか確認する。
クリーンブートの実施
アプリケーション同士が干渉することで、エラーが発生することがあります。クリーンブートで不要なスタートアッププログラムを無効化し、競合を特定することで問題を解決します。具体的な手順は次の通りです。
- Windowsキー + Rを押して「msconfig」と入力し、Enter。
- 「システム構成」画面で「サービス」タブを選択し、「Microsoftのサービスをすべて隠す」にチェックを入れる。
- 「すべて無効」をクリックして、適用する。
- 「スタートアップ」タブで「タスクマネージャーを開く」を選択。
- 不要なスタートアップ項目を無効にし、「OK」をクリックする。
- PCを再起動し、問題が解消されたか確認する。
これまでの対処法で解決できなかった場合は重大なエラーが発生している可能性が高いです。重要なデータが保存されている場合は専門業者に問い合わせることをおすすめします。
なぜデジタルデータリカバリーでは復旧困難な機器の復旧事例が多いのか
デジタルデータリカバリーはこれまで数々の復旧に成功してきました。復旧事例が多いのには、理由があります。
業界トップクラスの実績

私たちデジタルデータリカバリーは、14年連続で国内売上No.1(※1)。累計46万件以上(※2)の相談実績をもとに、あらゆるデータトラブルと向き合ってきました。
「データが戻ってくるかどうかは、最初の診断で決まる」
そう言っても過言ではありません。
最大の強みは、その“症例データの蓄積数”。
すべての相談内容を電子カルテのように管理し、障害のパターンと復旧手法を社内でデータ化。
これにより、問題の切り分けが圧倒的に早くなり、対応スピードと成功率の向上につながっています。
その結果、48時間以内に対応を完了した件数は全体の約80%。
一部復旧を含む復旧件数割合は91.5%(※3)と、業界でも高水準の成果を出し続けています。
国内最高峰の復旧設備

復旧の成功事例の多さは、デジタルデータリカバリーの技術力の高さを象徴しています。復旧成功の要因として、次の点が挙げられます:
- 蓄積された知見に基づき、障害箇所を正確に特定
- 最新技術を駆使した独自の復旧手法を開発
- 精密な環境での復旧作業(専用クリーンルーム完備)
これらの要素が、他社では対応が難しいケースでも「不可能を可能に」しています。
「他社で復旧できなかった機器のご相談件数7,300件超」ですので、他社で復旧してもらえなかった機器であっても、デジタルデータリカバリーでは復旧できる可能性もございます。是非ご相談ください。
初期診断・相談・見積まで無料で対応可能
初期診断とは、機器に発生した障害の原因を正確に特定し、復旧の可否や復旧方法を確認する工程です。デジタルデータリカバリーでは、経験豊富な技術者が「初期診断」を行い、内部の部品にダメージを与えることなく問題を見つけます。
データ障害のパターン15,000種類以上もありますが、「ご相談件数46万件超」(算出期間:2011年1月1日~)を持つ当社は、それぞれの障害原因をデータベースから即座に情報を引き出し、原因を正確に特定できる体制を整えています。
※1:データ復旧専門業者とは、自社及び関連会社の製品以外の製品のみを対象に保守及び修理等サービスのうちデータ復旧サービスを専門としてサービス提供している企業のこと、 第三者機関による、データ復旧サービスでの売上の調査結果に基づく。(集計期間:2007年~2020年)
※2:期間:2011年1月1日~
※3:2023年10月実績。一部復旧:完全復旧に至らなかったが、一部復旧できた場合。完全復旧:復旧希望データを100%復旧できた場合。
よくある質問
いえ、かかりません。当社では初期診断を無料で実施しています。お客様の機器に初期診断を行って初めて正確なデータ復旧の費用がわかりますので、故障状況を確認しお見積りをご提示するまで費用は頂いておりません。
※ご郵送で機器をお預けいただいたお客様のうち、チェック後にデータ復旧を実施しない場合のみ機器の返送費用をご負担頂いておりますのでご了承ください。
機器の状態によって故障の程度が異なりますので、復旧完了までにいただくお時間はお客様の機器お状態によって変動いたします。
弊社は、復旧完了までのスピードも強みの1つで、最短即日復旧・ご依頼の約8割を48時間以内に復旧完了などの実績が多数ございます。ご要望に合わせて柔軟に対応させていただきますので、ぜひご相談ください。
営業時間は以下の通りになっております。
365日24時間、年中無休でお電話でのご相談・復旧作業・ご納品・アフターサービスを行っています。お困りの際は是非ご相談ください。
電話受付:0:00~24:00 (24時間対応)
電話番号:0800-333-6302
来社受付:9:30~21:00
復旧できる可能性がございます。
弊社では他社で復旧不可となった機器から、データ復旧に成功した実績が多数ございます。 他社大手パソコンメーカーや同業他社とのパートナー提携により、パートナー側で直せない案件を数多くご依頼いただいており、様々な症例に対する経験を積んでおりますのでまずはご相談ください。
この記事を書いた人
デジタルデータリカバリー データ復旧エンジニア
累計相談件数46万件以上のデータ復旧サービス「デジタルデータリカバリー」において20年以上データ復旧を行う専門チーム。
HDD、SSD、NAS、USBメモリ、SDカード、スマートフォンなど、あらゆる機器からデータを取り出す国内トップクラスのエンジニアが在籍。その技術力は各方面で高く評価されており、在京キー局による取材実績も多数。2021年に東京都から復旧技術に関する経営革新優秀賞を受賞。